Не жетіспейді
Бұл бетті сіз оқып отырған тілдің иесі тексерген жоқ. Сала терминдері дәл берілмеуі мүмкін; сандар мен олардың астындағы дереккөздер барлық тілде бірдей.
Мына сәйкестік картасында әр бөлімнің тұсында «ішінара» деп тұр. Мұнда сол сөздің артында не тұрғаны айтылған: 9 бөлім бойынша 16 олқылық.
Тізім оның қалай көрінетініне қарамай жазылған. Жүйені ашқан маман мұнда айтылмай қалғанды бәрібір табады — содан кейін ешнәрсеге сенбейді. Шекараны он минутта білу екі жаққа да енгізудің үшінші айында білгеннен тиімдірек.
General Rules
Section 01 ↗Есеп жүргізудің жалпы ережелері: жазбаларды кім жүргізеді, олардың сенімділігі қалай расталады, есеп ұйымы не істейді және асыл тұқым өсіруші алдында не үшін жауап береді.
Қазір қалай. Рөлдер, қолжетімділік құқықтары және әр жазба бойынша өзгерістер журналы. Жазбаларды Қауымдастықтың верификациялауы — өтінімдердің бөлек ағыны.
Рәсімдердің сыртқы аудиті жоқ.
Немен қауіпті. Тек өзін жазған адам тексеретін ереже — бұл ереже емес, уәде. Бөлім сенімділікті үшінші тарап растайтынына құрылған, және оны өз тексеруімізбен ауыстыруға болмайды.
Ол үшін не керек. Herd-book recording және Data processing бағыттары бойынша ICAR Certificate of Quality — әлемдегі асыл тұқым кітабын жүргізудің жалғыз салалық сертификаттауы. Ол тек ICAR мүшелеріне қолжетімді, ал бұл кодтан тыс нәрселерге тіреледі (docs/icar.md қараңыз).
Есеп рәсімдері жеке құжатпен жазылмаған.
Немен қауіпті. Жұмыс тәртібі кодта және әзірлеушінің шешімдерінде тұр. Жүйені бір адам жүргізіп тұрғанда бұл жұмыс істейді; Қауымдастыққа берілгенде немесе аудит кезінде — жоқ.
Ол үшін не керек. Кітапты жүргізу регламенті: кім енгізеді, кім тексереді, қандай мерзімде, не қате болып саналады және ол қалай түзетіледі. Бұл жүйенің емес, Қауымдастықтың жұмысы.
Cattle Milk Recording
Section 02 ↗Сүт өнімділігін есепке алу: бақылау сауымдарының схемалары, олардың арасындағы аралықтар, лактацияны есептеу, әдісті белгілеу (A4, B4 және басқалары), өткізіп алынған бақылаулармен жұмыс.
Қазір қалай. Күні, сүті, майы, ақуызы және соматикасы бар бақылау сауымдары; лактация солардан есептеледі, сан болып енгізілмейді. Бақылау әдісі стандарттың тізбелерімен жазылады: көрсеткіштерді кім алды, қандай сауымдар кірді, сынама қалай және қашан алынды, — ал үйреншікті A4 немесе B4 белгісі солардан жиналады, жол болып сақталмайды. Тексерулер сауымдар қатарындағы үзілістерді және міндетті көрсеткіштері жоқ лактацияларды табады.
Бақылаулар арасындағы аралық тексерілмейді.
Немен қауіпті. Бөлім рұқсат етілген аралықтарды белгілейді, ал олардан шығу лактацияның тым сирек нүктелер бойынша есептелгенін білдіреді. Біздің тексеру созылған аралықты емес, тек қатардағы толық үзілісті табады.
Ол үшін не керек. Тексерулер тізілімінде ереже: көрші сауымдар арасындағы аралық күнмен.
DNA Technology
Section 04 ↗Генотиптермен жұмыс: шығу тегін растау және нақтылау, ұйымдар арасында генотиптермен алмасу, зертханаларға қойылатын талаптар.
Қазір қалай. Зертханасы, күні, әдісі және шығу тегін растау нәтижесі бар ДНҚ-тест; жазылған ата-анамен қайшылық тексерулерге түседі.
ISAG STR панелі сақталады, бірақ чиптік генотиптер сақталмайды.
Немен қауіпті. Он екі локус шығу тегін растауға жетеді, ал геномдық бағалауға да, генотип алмасуға да жетпейді: онда есеп ондаған мың SNP-пен жүреді. Чип файлдарын кітап мүлдем қабылдамайды, ал зертхана ауысқанда бұрынғы генотиптеуден деректер емес, хаттама ғана қалады.
Ол үшін не керек. Он екі міндетті STR қазірдің өзінде сақталады; чиптік генотиптер алты қадамды талап етеді, және олардың бірде-бірі аттап кетілмейді. Біріншісі — оларды беретін үш форматты қабылдау: панель манифесімен бірге Illumina чипінің есебі, PLINK файлдарының жұбы және жарияланған геном құрастырмасы бар VCF. Екіншісі — бір аллель кодтауына және бір құрастырмаға келтіру: дәл сол генотип TOP, FORWARD және AB-де әртүрлі көрінеді, ал ARS-UCD 1.2 мен 2.0-дегі маркер позициялары сәйкес келмейді. Үшіншісі — ортақ тірек панелі және оған дейінгі импутация, әйтпесе әртүрлі чиптегі жануарлар өзара салыстырылмайды. Төртіншісі — сынаманың жануармен байланысы: зертханадағы үлгі идентификаторы жануар нөміріне тең емес, ал генотиптеуге өтінімсіз нәтиже ілініп қалады. Бесіншісі — сапа бақылауы: үлгі бойынша және маркер бойынша оқылған маркерлер үлесі, сирек аллель жиілігі, жынысты салыстыру және жазылған шежіремен салыстыру. Алтыншысы — сақтау: бір жануарға елу мың маркер базада жол болып өмір сүрмейді, кітаптағы метадеректермен бірге екілік форматтағы файл керек — жануар, зертхана, панель, күн, маркерлер саны, оқылғандар үлесі және файлдың бақылау сомасы. Тек содан кейін ғана гомозиготалық учаскелер, геномдық туыстық және шығарып тастау ықтималдықтары есептеледі. ADE стандарты мұнда көмекші емес — онда генотиптер мүлдем жоқ.
Басқа ұйымдармен генотип алмасу жоқ.
Немен қауіпті. Халықаралық алмасу GenoEx-PSE арқылы жүреді, ал ол жабық: ICAR мүшелігі және DNA Data Interpretation Centre ретінде сертификаттау керек. Жиырма жеті орталықтың тізімінде ресейлік ұйымдар жоқ.
Ол үшін не керек. Алдымен — генотиптерді өзімізде сақтау; алмасу сыртқы жағдай өзгергеннен кейін ғана мүмкін.
Conformation Recording
Section 05 ↗Экстерьерді бағалау: тоғыз балдық шкаладағы сызықтық белгілер, жүз балдық шкаладағы жиынтық бағалар, бағалаушыға және бағалардың қайталанымдылығына қойылатын талаптар.
Қазір қалай. 1–9 белгілері бойынша сызықтық баға, 50–100 жиынтық бағалары және төлді бағалау. Әр бағада бағалаушы мен күні жазылған. Он алты сызықтық және төрт жиынтық белгі ADE бойынша алмасқанда ICAR номенклатурасына салыстырылады.
Екі жиынтық белгі ICAR номенклатурасына сыймайды.
Немен қауіпті. «Дене көлемі» және «дененің артқы үштігі» — біздің құрама көрсеткіштеріміз, және icarConformationTraitType тізбесінде оларға сәйкестік жоқ. Алмасқанда олар жай ғана кетпейді. Оларды мағынасы жақындарының орнына жіберу бөтен жүйеге санды бөтен атпен жіберу болар еді.
Ол үшін не керек. Не Қауымдастықтың ICAR белгілерінің құрамына көшу шешімі, не осы екеуінің ішкі болып қалатынын мойындау. Бұл техникалық емес, зоотехникалық шешім.
Бағалаушылардың бағаларының қайталанымдылығы тексерілмейді.
Немен қауіпті. Бөлім әртүрлі бағалаушылардың бір малға жақын баға қоюын және мұның өлшенуін талап етеді. Мұндай тексерусіз экстерьер рейтингі сиырды емес, нақты бағалаушының әдеттерін көрсетеді.
Ол үшін не керек. Бір малды әртүрлі бағалаушылардың қайта бағалауы және айырманы есептеу. Бұл деректерді әдейі жинау керек — қарапайым жұмыстан олар шықпайды.
AI and ET Data and Fertility Analysis
Section 06 ↗Ұрықтандыруларды және эмбрион көшіруді есепке алу, ұдайы өндіру көрсеткіштерін есептеу: сервис-кезең, бұзаулау аралығы, ұрықтандыру индексі.
Қазір қалай. Бұқасы, дозасы, техникі және нәтижесі бар ұрықтандырулар; сервис-кезең мен бұзаулау аралығы оқиғалардан есептеледі. Тексерулер тым қысқа бұзаулау аралығын және бұзаулаудан бұрынғы ұрықтандыруды табады.
Эмбрион көшіру жүргізілмейді.
Немен қауіпті. Бөлім эмбрион көшіруді де қамтиды, ал бізде шаю да, донор мен реципиент те, эмбрионға құжаттама да жоқ. Көшіруден туған бұзау кәдімгідей жазылады, және оның шежіресі дұрыс болмай шығады: генетикалық ананың орнына оған реципиент-ана түседі.
Ол үшін не керек. Шаю оқиғасы, эмбрион карточкасы, шежіредегі «реципиент» туыстық түрі. ADE-де бұның бәрі бар: icarReproEmbryoFlushingEventResource, icarReproEmbryoResource және icarAnimalRelationType ішіндегі Recipient мәні. Тіркеу кезінде WHFF ережелерімен талап етіледі.
Bovine Functional Traits
Section 07 ↗Функционалдық белгілер: желін денсаулығы, бұзаулаудың жеңілдігі, төлдің сақталуы, ұзақ өмірлілік — нақты нені жазу керек және оны қалай кодтау керек.
Қазір қалай. Бақылау сауымдары бойынша соматика, бұзаулаудың жеңілдігі, тірі және өлі төл, күні мен себебі көрсетілген шығып қалу.
ICAR-дың бірыңғай денсаулық коды (Central Health Key) пайдаланылмайды.
Немен қауіпті. Аурулар туралы жазбалар анықтамалық талап еткеннен еркінірек жүргізіледі, және мастит жиілігін бізде және басқа елде салыстыруға болмайды: онда — код, бізде — мәтін. Осы денсаулық белгілерін халықаралық бағалауға жолды да жабады.
Ол үшін не керек. Central Health Key анықтамалығы, емдеу мен диагноздың код өрісі, бар жазбаларды аудару. Дәл сол кодты ADE icarDiagnosisEventResource ішінде пайдаланады.
Бұзаулаудың жеңілдігі бес дәреженің орнына үшеуімен.
Немен қауіпті. Бізде «жеңіл, көмекпен, ауыр», ал халықаралық шкалада кесар тілігі бөлек тұрған бес дәреже бар. Алмасқанда біздің үшеуіміз бөтен бесеуге бір мәнді жайылады, ал кері — жоқ: екі түрлі бөтен мән бізде біреуге келеді, және айырма үнсіз жоғалады.
Ол үшін не керек. Анықтамалықты icarReproCalvingEaseType бойынша бес дәрежеге дейін кеңейту және бар жазбаларды аудару.
Dairy Cattle Genetic Evaluation
Section 09 ↗Сүтті малды генетикалық бағалау: асыл тұқымдық құндылық неден жиналады, сенімділік қалай есептеледі, нәтижелер қалай жарияланады және салыстыру базасы.
Қазір қалай. Салмақ профильдері, әр белгі бойынша және тұтас индекс бойынша сенімділігі бар, мәннің қасында салыстыру базасының нұсқасы тұрған асыл тұқымдық құндылық индексі. Кітап бойынша рейтинг атын атап жарияланады.
Салыстыру базасы өзіміздікі емес, алынған.
Немен қауіпті. Стандартты ауытқулар мен тұқым қуалаушылық америкалық CDCB-2025 базасынан алынған және метрлік бірліктерге аударылған. Ресейлік популяция үшін олар шамамен: индекс іштей келісілген, бірақ оның абсолютті мәні базасы өзінікі елдегімен бірдей нәрсені білдірмейді.
Ол үшін не керек. Ресейлік популяция бойынша генетикалық параметрлерді есептеу — жүйенің емес, ғылыми мекеменің жұмысы. Біздің үлесіміз — ауысу қадағаланатындай әр мәннің қасында база нұсқасы; бұл жасалған.
Генетикалық трендтің валидациясы жоқ.
Немен қауіпті. Бөлім бағаның жылдан жылға «жылжымайтынын» тексеруді талап етеді: Interbull-дың I–III әдістері дәл осы туралы. Мұндай тексерусіз базаның баяу ығысуы генетикалық ілгерілеу болып көрінеді, және ауыстыруды байқау мүмкін емес.
Ол үшін не керек. I–III әдістерімен тренд валидациясы тесттерін іске асыру. Ол ешқандай мүшеліксіз жасалады және Interbull-ға қатысу ешқашан болмаса да, дұрыс архитектура болып қалады.
Баға халықаралық салыстыруға қатыспайды.
Немен қауіпті. Interbull MACE әртүрлі елдердің бағаларын ортақ шкалаға келтіреді. Онсыз біздің индекс бөтенмен ешбір бағытта салыстырылмайды — бұқаны да салыстыру мүмкін емес, импорттық сиырды бағалау да.
Ол үшін не керек. ICAR мүшелігін және ортақ базадағы валидацияланған ұлттық бағаны талап етеді. Бүгін жабық.
Data Exchange
Section 15 ↗Жүйелер арасында деректер алмасу: сөздіктер, форматтар, схемалар. Қазіргі бағыт — JSON мен REST негізіндегі ашық ADE стандарты, спецификациясы GitHub-та Apache 2.0 лицензиясымен жатыр.
Қазір қалай. ФГИАС ПР-мен тізілімнің жиырма шаблоны бойынша алмасу — жүктеп беру және кері жүктеу. Кітаптың өз REST-интерфейсі. Спецификациядағы мекенжайлар бойынша 14 ADE коллекциясын беру (animals, test-day-results, parturitions, inseminations, type-classifications, weights, breeding-values, arrivals, departures, deaths, pregnancy-checks, milking-visits, daily-milking-averages, diagnoses). Олардың 7 бойынша POST қабылдау (test-day-results, parturitions, inseminations, weights, milking-visits, diagnoses, breeding-values) — қайта жіберуді «дереккөз және оның жазба нөмірі» жұбымен тану, жолма-жол icarBatchResult жауабы және icarErrorResource түріндегі бас тартулармен. Берілетіні біздің тізбелер көшірмемізбен емес, adewg/ICAR репозиторийіндегі нағыз схемалармен салыстырылады. Іріктеу — стандарттың өз атауларымен: жазба күні бойынша meta-modified-from және meta-modified-to, оқиға күні бойынша date-from және date-to, мал бойынша animal-id мен animal-scheme жұбы; түсінілмеген параметрлер үнсіз тасталмай, жауаптың тақырыбында аталады. Мал, экстерьер бағасы, асыл тұқымдық құндылық және орын ауыстырулар жазуға әдейі жабық: малды тіркеу және құқықтардың ауысуы — Қауымдастық жауап беретін тұжырымдар, олар алмасу ағынындағы жол емес, тексерілетін өтінім арқылы жүреді; әрқайсысына түсіндірмесі бар 405 жауап беріледі.
Алмасуда стандарттың 14 ресурсы, ал олар елуге жуық.
Немен қауіпті. Алмасудың екі тәсілі де толық жұмыс істейді, бірақ олар кітап жүргізетінді тасиды. Емдеу, азықтандыру, топтық оқиғалар, сою, аспап көрсеткіштері — бұл стандарттың бізде кітаптың өзінде жоқ ресурстары, және алмасудың бұған қатысы жоқ: таситын нәрсе жоқ. Емдеудің себебі бөлек және бас тартуда клиентке айтылады: күту мерзімін сақтайтын жер жоқ, ал жазбаны қабылдап, оны жоғалту қабылдамағаннан жаман.
Ол үшін не керек. Кітапта тиісті бөлімдерді жүргізу. Алмасу оларды хаттаманы түземей-ақ қосып алады: коллекция мекенжайы мен деректер жиыны бір жолмен енгізіледі — стандарт дәл сол үшін ресурс түріне тәуелсіз жасалған.
Breed Associations
Section 18 ↗Тұқымдық қауымдастықтардың жұмысы және асыл тұқым кітаптарын жүргізу: малды кітапқа жазу ережелері, кітаптың бөлімдері, шығу тегіне және мүшелікке қойылатын талаптар.
Қазір қалай. Кітапты жүргізу, шаруашылықтардың мүшелігі, асыл тұқым куәліктерін беру, өтінімдерді талдау, жазбаларды верификациялау.
Асыл тұқым кітабының бөлімдері жоқ.
Немен қауіпті. Халықаралық тәжірибеде кітап таза тұқымдылық дәрежесі бойынша бөлінеді (негізгі бөлік, қосымшалар), және малдың не ала алатыны және қандай бағаға сатылатыны бөлімге байланысты. Бізде кітап біреу және жалпақ.
Ол үшін не керек. Қауымдастықтың бөлімдер құрылымы туралы шешімі, содан кейін малдағы бөлім өрісі және оған түсу ережелері. Біріншісі екіншісінен маңыздырақ және біздің жұмысымыз емес.
Шежіре бес ұрпаққа кепілдік бермейді.
Немен қауіпті. WHFF-тің Registration Guidelines құжаты өнімділік деректері бар бес ұрпақты және олардың ішінде голштин емес атаның белгісін талап етеді. Біз деректе қанша бар, сонша жинаймыз және шежіренің қай жерде үзілетінін немесе оған қай жерде бөтен тұқым кіретінін белгілемейміз.
Ол үшін не керек. Малдағы шежіре толықтығының белгісі, бес ұрпақ ішіндегі бөтен тұқымның белгісі, Mulefoot, BLAD, CVM, DUMPS рецессивтерінің кодтары.
Мұның қайсысы кодқа байланысты емес
Олқылықтардың бір бөлігі жұмыспен жабылады, бір бөлігі — шешіммен, және оларды шатастырмаған жөн. Асыл тұқым кітабының бөлімдері, экстерьер белгілерінің құрамы және бақылау әдістерінің құрылымы — Қауымдастықтың шешімі: жүйе олай да, былай да істей алады, ал таңдауды тұқым үшін жауап беретін адам жасауға тиіс. Ресейлік популяция бойынша генетикалық параметрлерді есептеу — ғылыми мекеменің жұмысы. Бағалауларды халықаралық салыстыру мен кітап жүргізу сапасын сертификаттау ICAR мүшелігіне тіреледі, ал бұл — бөлек әңгіме, онда бізге байланысты нәрсе аз.